Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms