Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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