Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB3O43889 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms