Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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