Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TO15178 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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