Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 ABHD11-AS1-202ENST00000641969 358 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms