Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJA3Q9Y6H8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
GJA3Q9Y6H8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA3Q9Y6H8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms