Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDY1Q9Y6F8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms