Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARP3Q9Y6F1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARP3Q9Y6F1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms