Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD54BQ9Y620 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD54BQ9Y620 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms