Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
RAD54L2Q9Y4B4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RAD54L2Q9Y4B4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
RAD54L2Q9Y4B4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
RAD54L2Q9Y4B4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms