Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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HCN4Q9Y3Q4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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HCN4Q9Y3Q4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
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HCN4Q9Y3Q4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
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HCN4Q9Y3Q4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCN4Q9Y3Q4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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HCN4Q9Y3Q4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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HCN4Q9Y3Q4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCN4Q9Y3Q4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCN4Q9Y3Q4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCN4Q9Y3Q4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HCN4Q9Y3Q4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HCN4Q9Y3Q4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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HCN4Q9Y3Q4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCN4Q9Y3Q4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCN4Q9Y3Q4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCN4Q9Y3Q4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCN4Q9Y3Q4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCN4Q9Y3Q4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCN4Q9Y3Q4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCN4Q9Y3Q4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCN4Q9Y3Q4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCN4Q9Y3Q4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HCN4Q9Y3Q4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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