Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q0

NAALAD2, N-acetylated-alpha-linked acidic dipeptidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAALAD2Q9Y3Q0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NAALAD2Q9Y3Q0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAALAD2Q9Y3Q0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAALAD2Q9Y3Q0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms