Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
THRAP3Q9Y2W1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
THRAP3Q9Y2W1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
THRAP3Q9Y2W1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms