Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIF3AQ9Y2N7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF3AQ9Y2N7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms