Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAN1Q9Y2M0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAN1Q9Y2M0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAN1Q9Y2M0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms