Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
USP20Q9Y2K6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP20Q9Y2K6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP20Q9Y2K6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms