Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNND2Q9UQB3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNND2Q9UQB3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND2Q9UQB3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms