Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNPO2Q9UMS6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNPO2Q9UMS6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms