Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN11Q9UMQ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN11Q9UMQ6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN11Q9UMQ6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms