Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCOLCE2Q9UKZ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCE2Q9UKZ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms