Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX41Q9UJV9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX41Q9UJV9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms