Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MID2Q9UJV3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.8 ms