Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSR3Q9UJK0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms