Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PLXNA1Q9UIW2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLXNA1Q9UIW2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms