Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PUF60Q9UHX1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PUF60Q9UHX1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms