Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
OPN4Q9UHM6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OPN4Q9UHM6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OPN4Q9UHM6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OPN4Q9UHM6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OPN4Q9UHM6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OPN4Q9UHM6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OPN4Q9UHM6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
OPN4Q9UHM6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OPN4Q9UHM6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OPN4Q9UHM6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms