Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO40Q9UH90 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms