Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms