Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DNAJB4Q9UDY4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJB4Q9UDY4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms