Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBP1Q9NZI7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBP1Q9NZI7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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