Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP4R2Q9NY27 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PPP4R2Q9NY27 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP4R2Q9NY27 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms