Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL11Q9NVR0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL11Q9NVR0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL11Q9NVR0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL11Q9NVR0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL11Q9NVR0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms