Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ9

FAM49B, Protein FAM49B, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49BQ9NUQ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM49BQ9NUQ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM49BQ9NUQ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms