Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
PDS5BQ9NTI5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PDS5BQ9NTI5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PDS5BQ9NTI5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2623.1 ms