Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB6BQ9NRW1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB6BQ9NRW1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms