Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
DUOX2Q9NRD8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.82■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.79■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DUOX2Q9NRD8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms