Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
DMRT3Q9NQL9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DMRT3Q9NQL9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms