Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRKRIP1Q9H875 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRKRIP1Q9H875 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms