Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF3Q9H4W6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF3Q9H4W6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.4 ms