Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EHD4Q9H223 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EHD4Q9H223 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EHD4Q9H223 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms