Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms