Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD1Q9GZZ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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