Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDGFDQ9GZP0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDGFDQ9GZP0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms