Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHLHE41Q9C0J9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE41Q9C0J9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms