Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM8Q9BZR9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms