Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SCAPERQ9BY12 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SCAPERQ9BY12 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SCAPERQ9BY12 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms