Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RNF17Q9BXT8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RNF17Q9BXT8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms