Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP5Q9BXF6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms