Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGR4Q9BXB1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LGR4Q9BXB1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms